Vom 1. August 1993 bis zum 15.02.2009 war Ursula Seitz als Rektorin an der Grundschule Südost tätig und wechselte anschließend an das Staatliche Schulamt im Landkreis Günzburg. Seit dem 1. August 1994 gehört Maria Hubensteiner als Konrektorin zum Schulleitungsteam. Sie leitete eigenverantwortlich die Schule vom 16.02.2009 bis zum 31.07.2009.

Am 01.08.2008 übernahm Rektor Wolfgang Hackel die Schulleitung an der Grundschule Südost. Er war zuvor Schulleiter an der Alois-Kober-Volksschule Kötz.